會計室
依法辦理歲計、會計及統計等事項。
人事室
依法辦理人事管理等事項。
綜合規劃組
研擬或協調推動家庭暴力、性侵害及性騷擾相關安全維護作為與防治措施、建構與開發服務網絡、蒐集分析、研究或編印相關資料、資訊建檔與管理及其他綜合規劃與行政等事項。
專線及調查組
二十四小時保護專線受案、派案及追蹤聯繫、二十四小時緊急救援規劃協調及諮詢服務等事項。
兒少保護組
兒童少年保護個案危機處遇、評估、個案管理及相關服務等事項。
成人保護組
成人保護個案危機處遇、評估、個案管理及相關服務等事項。
性侵害保護組
性侵害保護個案危機處遇、評估、個案管理及相關服務等事項。。
暴力防治組
協調警察局辦理二十四小時緊急救援、偵訊、護送就醫、出庭、協助保護令聲請及其他防治等事項。
醫療服務組
協助被害人診療驗傷、傷害證據保全、身心治療與轉介服務、加害人處遇計畫，以及建立醫療服務網絡等事項。
教育輔導組
學校家庭暴力及性侵害防治教育課程、事件處理、就學服務、通報防治宣導與研習、培訓校園推廣教育之師資與種子教師訓練、督導工作及其他教育輔導等事項。